染色质免疫共沉淀（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）是在体内研究DNA与蛋白质相互作用的重要工具。
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iTRAQ技术依托于溶液同位素标记体系，利用同位素质量标签对蛋白质进行标记，使具有相同的离子化能力，将标记蛋白质混合起来，应用液相色谱与质谱串联进行分析，可以通过比较质谱峰的强弱得到相对定量的数值。
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凝胶迁移或电泳迁移率实验（electrophoretic mobility shift assay，EMSA），是一种研究DNA与蛋白质或RNA与蛋白质相互作用的常用技术
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