文末有亮点!一定要看完哦!
细菌基因组重测序是对基因组序列已知的细菌个体进行基因组测序,通过与已知的参考基因组比对,获得该细菌个体或群体的差异的测序方法。
这些差异主要包括SNP、InDel、和SV(如下图)。目前微生物基因组重测序被广泛应用于病原微生物的检测及鉴定、病原菌演变及起源、致病菌种群结构及种群结构的进化等众多方面。
图1 SNP示意图
图2 Insertion示意图
图3 Deletion示意图
图4 SV示意图
两种变异鉴定策略,让细菌基因组变异无处可藏
我们提供两种比对参考基因组的策略,一种是基于Read比对,另一种是基于Read组装的序列(Contig)比对。你可以任意指定一种适合实验设计和样本特性的比对方式,进行基因组变异鉴定和注释。基于我们的经验,基于组装序列的比对方式,对于SV的检测会更具优势。分析流程如下图。
图5 联川细菌基因组重测序分析策略
从宏观到微观,广泛的微生物组研究解决方案
无论你是做微生物群落多样性分析,还是做宏基因组功能解析,还是研究单个细菌的基因组或是基因组上的变异,我们都有成熟的解决方案,任你选!
微生物群落多样性分析(16S rDNA测序/ITS测序)
宏基因组功能解析(宏基因组测序)
细菌基因组测定(细菌完成图测序)
细菌基因组变异鉴定(细菌基因组重测序)
细菌基因组重测序限时特惠
2016.5.18至2016.6.30日,前100个细菌基因组重测序样本,【特惠价1999元/样本】。此优惠不与其他活动同享。赶紧约起!
回复“案例”,查看联川合作课题组近期发表的研究工作
本周(5.16~5.20),我们将到访古都西安,继续春季全国巡讲的行程。
西安的小伙伴,快来现场与我们互动,现场有惊喜哦!
回复“巡讲”,查看联川2016春季巡讲主题与日程。