Carrier RNA常见类型、作用原理及优缺点介绍
1. Carrier RNA概念及作用
荧光定量PCR是分子诊断主流技术，包括核酸提取和PCR扩增两个环节，两者共同决定了该检测方法的评测参数。以最直观最关键的检测灵敏度指标来看，只有实现了提取环节最优化和PCR扩增环节最优化的情况下，检测灵敏度的结果才更可信。检测灵敏度显示了检测试剂的检测下限，对于荧光定量PCR而言，即一定样本浓度下的病毒核酸检出率。
Carrier RNA，中文名载体RNA，又叫核酸助沉剂。在核酸提取环节，提取使用到的离心管壁多是聚丙烯的材料，管壁上有静电，会吸附核酸。在提取纯化过程中采用Carrier RNA 可帮助核酸去除静电效应，保证核酸能很好被吸附到纯化柱上，提高洗脱效率，从而达到尽可能多的回收样本中核酸！
2. Carrier RNA常见类型
作为核酸沉淀的辅助物质，Carrier RNA有多种类型。
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类型 |
代表物质 |
作用原理 |
|
多聚糖 |
糖原 |
RNA在高盐、无水乙醇环境中溶解度很低，通过高速离心可发生沉淀。当RNA浓度很低时，微量RNA不足以形成沉淀。在上述环境条件下，糖原也不可溶并可与RNA共沉淀，形成可视化沉淀。 |
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核酸混合物 |
PolyA钾盐、大肠杆菌总RNA、酵母总RNA、tRNA等 |
减少吸附损失，降低核酸酶攻击待提取核酸的概率。 |
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其他 |
线性化丙烯酰胺 |
减少吸附损失 |
3. 产品介绍——上海翌圣生物生产的Carrier RNA
翌圣生物Carrier RNA是酵母来源的RNA，无DNase、RNase酶残留，蛋白和DNA残留含量极低。可用于病毒核酸提取、微量DNA提取等实验，提取的核酸可用于后续RT-PCR，RT-qPCR等实验。产品分为液体和冻干型粉末制剂，便于直接使用和长距离运输、保存。
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产品名称 |
产品编号 |
规格 |
保存条件 |
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Carrier RNA, 6 μg/μL |
19701ES03 |
1 mL |
-20℃保存，可保存2年 |
|
Carrier RNA Powder, 216 μg/tube |
19703ES01 |
1 tube |
室温保存，可保存1年 |
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Carrier RNA Powder, 310 μg/tube |
19704ES01 |
1 tube |
室温保存，可保存1年 |
本品为核酸混合物，产品使用非常简单，在纯化核酸过程中通过添加微克量（μg）的Carrier RNA，即可实现提升低至皮克级别（pg）微量核酸的沉淀效率，达到提升试剂检测灵敏度的目的。
其作用原理主要是通过混入大量核酸（Carrier RNA），减少了目标核酸物质的管壁吸附损失，进而提高微量的核酸纯化柱上的结合和洗脱效率，同时降低了提取环境中的RNase降解微量RNA的概率。
4. 应用案例
● Carrier RNA的加入有助于低丰度SARS-CoV-2假病毒核酸检测
使用磁珠法拭子样本病毒DNA/RNA提取试剂盒，提取不同浓度的SARS-CoV-2假病毒样本核酸，后续使用新冠检测试剂盒进行检测N基因。结果显示，添加Carrier RNA后，具有更高的提取效率，使下游检测更灵敏。
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Ct值 |
0 copies/mL |
125 copies/mL |
250 copies/mL |
500 copies/mL |
1000 copies/mL |
NTC |
|
不加carrier RNA |
N/A; N/A; N/A |
N/A; N/A; N/A |
N/A; 40.4; N/A |
N/A; 40.16; 40.88 |
38.05; 38.02 |
N/A; N/A; N/A |
|
加carrier RNA |
N/A; N/A; N/A |
N/A; 40.54; N/A |
40.2; 40.29; 38.95 |
38.61; 39.03; 38.59 |
37.53; 36.34 |
见图1-1
● Carrier RNA放置于65℃不同时间（3d,6d,9d）后，与提取性能标准保存条件一致
将Carrier RNA粉末分别放置于65℃ 3d，6d，9d进行加速试验测试，测试方案为：使用磁珠法拭子样本病毒DNA/RNA提取试剂盒，提取不同浓度的SARS-CoV-2假病毒样本核酸，后续使用新冠检测试剂盒进行检测orf1ab和N基因。结果显示，与标准保存条件（-20℃）相比，置于65℃保存9天的Carrier RNA，性能不发生变化。
VIC：
|
Ct值 |
0 copies/mL |
250 copies/mL |
500 copies/mL |
1000 copies/mL |
2000 copies/mL |
NTC |
|
65℃ 3天 |
36.32; 36.03; 36.26 |
翌圣生物科技（上海）股份有限公司 商家主页地 址： 上海市浦东新区天雄路166弄一号楼三层南单元 联系人： 李自转 电 话： 400-6111-883、021-34615995-8075 传 真： 021-34615995-188 Email：lizizhuan@yeasen.com 相关咨询干货 | 见微知著，PCR那些不为人知的小细节！ (2024-11-25T00:00 浏览数:2318) 文库定量产品选购指南 (2024-11-25T00:00 浏览数:1771) 磁珠产品选购指南 (2024-11-25T00:00 浏览数:1657) 表观遗传系列产品选购指南 (2024-11-25T00:00 浏览数:2340) RNA建库系列产品选购指南 (2024-11-22T00:00 浏览数:8420) DNA建库系列产品选购指南 (2024-11-22T00:00 浏览数:4633) 全自动核酸提取仪，让HCD残留和支原体污染等检测更轻松&准确 (2024-11-22T00:00 浏览数:6777) 复制型逆转录病毒(RCR)的法规监管要求和检测方法介绍 (2024-11-22T00:00 浏览数:2791) 解决方案 | 病原tNGS产品助力病原检测更快捷 (2024-11-22T00:00 浏览数:8381) 翌圣Hieff Clone®系列分子克隆试剂盒（累计影响因子1300+） (2024-11-21T00:00 浏览数:10032) ADVERTISEMENT
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