环状RNA(circRNA-seq)高通量测序-其它资料-资讯-生物在线

环状RNA(circRNA-seq)高通量测序

作者:上海纽科生物科技有限公司 2022-08-01T00:00 (访问量:3285)

circRNA简介

circRNA是通过外显子反式剪接(back splicing)形成的一类共价闭合环状RNA,广泛存在于哺乳动物细胞中。circRNA能够抵抗RNA外切酶降解,因此比线性RNA更稳定。它们可以通过(1)竞争结合miRNA充当miRNA海绵,降低miRNA介导的基因表达调控的影响;(2)充当蛋白质海绵;(3)翻译成新的功能蛋白等。circRNA可以作为疾病诊断的biomarker,已经成为RNA领域新的研究热点。 circRNA测序技术通过去核糖体、去线性实验方案富集样品中的circRNA,然后经过高通量测序,检测并定量样品中的circRNA,是当前circRNA研究的首选方法。

送样指南

Total RNA:2 μg
细胞:2x106
组织:50 mg
全血、血清、血浆:2 mL

结果展示


经典案例

1. Yan B, Zhang Y, Liang C, Liu B, Ding F, Wang Y, Zhu B, Zhao R, Yu XY, Li Y. Stem cell-derived exosomes prevent pyroptosis and repair ischemic muscle injury through a novel exosome/circHIPK3/ FOXO3a pathway. Theranostics. 2020 May 18;10(15):6728-6742
2. Luo Z, Han L, Qian J, Li L. Circular RNAs exhibit extensive intraspecific variation in maize. Planta. 2019 Jul;250(1):69-78
3. Tagawa T, Gao S, Koparde VN, Gonzalez M, Spouge JL, Serquiña AP, Lurain K, Ramaswami R, Uldrick TS, Yarchoan R, Ziegelbauer JM. Discovery of Kaposi's sarcoma herpesvirus-encoded circular RNAs and a human antiviral circular RNA. Proc Natl Acad Sci U S A. 2018 Dec 11;115(50):12805-12810

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